Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BcanQ61361 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BcanQ61361 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BcanQ61361 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BcanQ61361 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BcanQ61361 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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BcanQ61361 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BcanQ61361 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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BcanQ61361 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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BcanQ61361 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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BcanQ61361 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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BcanQ61361 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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BcanQ61361 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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BcanQ61361 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BcanQ61361 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BcanQ61361 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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BcanQ61361 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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BcanQ61361 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BcanQ61361 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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