Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Bhlha9Q5RJB0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms