Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms