Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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