Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

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Length 882 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Sdc2-201ENSMUST00000022871 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp185-201ENSMUST00000114546 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42979-201ENSMUST00000196287 2228 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Irf2-201ENSMUST00000034041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 C130036L24Rik-202ENSMUST00000137643 3109 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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