Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Trim42-201ENSMUST00000035026 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 5830473C10Rik-201ENSMUST00000094615 2308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 1700019C18Rik-203ENSMUST00000222085 1766 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Rars-201ENSMUST00000018992 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Unc93a-201ENSMUST00000084966 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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