Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Traf3ip1Q149C2 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms