Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 AC164612.2-201ENSMUST00000215737 719 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm14083-201ENSMUST00000117873 620 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Fabp3-ps1-201ENSMUST00000070435 402 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm28533-202ENSMUST00000190106 1346 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm32284-201ENSMUST00000213704 1484 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms