Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms