Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Grin2cQ01098 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 380.1 ms