Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gjb2Q00977 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms