Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Aqp4P55088 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms