Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Apoc1P34928 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms