Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ms4a2P20490 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms