Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Ttc39b-203ENSMUST00000102823 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms