Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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H2-Eb1P04230 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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H2-Eb1P04230 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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H2-Eb1P04230 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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H2-Eb1P04230 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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