Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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Vmn1r167G3UW71 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Vmn1r167G3UW71 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Vmn1r167G3UW71 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Vmn1r167G3UW71 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Vmn1r167G3UW71 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Vmn1r167G3UW71 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Vmn1r167G3UW71 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Vmn1r167G3UW71 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Vmn1r167G3UW71 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Vmn1r167G3UW71 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Vmn1r167G3UW71 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Vmn1r167G3UW71 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Vmn1r167G3UW71 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r167G3UW71 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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