Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srp72F8VQC1 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms