Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Usf3B2RUQ2 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms