Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm6880A3KG45 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms