Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrit3W8DXL4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lrit3W8DXL4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrit3W8DXL4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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