Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Vstm4T1NXB5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vstm4T1NXB5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vstm4T1NXB5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms