Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Top3bQ9Z321 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Top3bQ9Z321 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms