Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Robo3Q9Z2I4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Robo3Q9Z2I4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.2 ms