Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd2Q9Z2E1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms