Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtmr1Q9Z2C4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtmr1Q9Z2C4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mtmr1Q9Z2C4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr1Q9Z2C4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr1Q9Z2C4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr1Q9Z2C4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr1Q9Z2C4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr1Q9Z2C4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr1Q9Z2C4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr1Q9Z2C4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr1Q9Z2C4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mtmr1Q9Z2C4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mtmr1Q9Z2C4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtmr1Q9Z2C4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtmr1Q9Z2C4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtmr1Q9Z2C4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtmr1Q9Z2C4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtmr1Q9Z2C4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtmr1Q9Z2C4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtmr1Q9Z2C4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtmr1Q9Z2C4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtmr1Q9Z2C4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtmr1Q9Z2C4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms