Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tulp1Q9Z273 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tulp1Q9Z273 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tulp1Q9Z273 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tulp1Q9Z273 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tulp1Q9Z273 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tulp1Q9Z273 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tulp1Q9Z273 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tulp1Q9Z273 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tulp1Q9Z273 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tulp1Q9Z273 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tulp1Q9Z273 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tulp1Q9Z273 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tulp1Q9Z273 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tulp1Q9Z273 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tulp1Q9Z273 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tulp1Q9Z273 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tulp1Q9Z273 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tulp1Q9Z273 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tulp1Q9Z273 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tulp1Q9Z273 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms