Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn8Q9Z260 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cldn8Q9Z260 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn8Q9Z260 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms