Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ap3b1Q9Z1T1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ap3b1Q9Z1T1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms