Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ddx39bQ9Z1N5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddx39bQ9Z1N5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx39bQ9Z1N5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.9 ms