Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf1Q9Z1B8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf1Q9Z1B8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf1Q9Z1B8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf1Q9Z1B8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf1Q9Z1B8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf1Q9Z1B8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf1Q9Z1B8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf1Q9Z1B8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf1Q9Z1B8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf1Q9Z1B8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf1Q9Z1B8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf1Q9Z1B8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf1Q9Z1B8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf1Q9Z1B8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf1Q9Z1B8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf1Q9Z1B8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf1Q9Z1B8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Phf1Q9Z1B8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms