Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Shcbp1Q9Z179 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shcbp1Q9Z179 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms