Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hmg20bQ9Z104 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hmg20bQ9Z104 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hmg20bQ9Z104 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms