Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z101

Pard6a, Partitioning defective 6 homolog alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6aQ9Z101 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6aQ9Z101 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6aQ9Z101 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6aQ9Z101 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6aQ9Z101 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6aQ9Z101 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6aQ9Z101 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6aQ9Z101 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6aQ9Z101 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6aQ9Z101 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6aQ9Z101 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6aQ9Z101 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6aQ9Z101 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6aQ9Z101 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6aQ9Z101 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6aQ9Z101 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6aQ9Z101 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6aQ9Z101 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6aQ9Z101 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6aQ9Z101 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pard6aQ9Z101 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6aQ9Z101 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6aQ9Z101 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6aQ9Z101 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6aQ9Z101 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6aQ9Z101 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6aQ9Z101 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6aQ9Z101 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pard6aQ9Z101 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms