Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skp2Q9Z0Z3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp2Q9Z0Z3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms