Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PapolbQ9WVP6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PapolbQ9WVP6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms