Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slit3Q9WVB4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slit3Q9WVB4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slit3Q9WVB4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms