Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Opn3Q9WUK7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn3Q9WUK7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms