Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lemd3Q9WU40 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Lemd3Q9WU40 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Lemd3Q9WU40 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms