Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nrf1Q9WU00 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nrf1Q9WU00 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nrf1Q9WU00 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms