Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PplQ9R269 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PplQ9R269 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PplQ9R269 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PplQ9R269 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PplQ9R269 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PplQ9R269 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PplQ9R269 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PplQ9R269 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PplQ9R269 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PplQ9R269 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PplQ9R269 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms