Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TapbpQ9R233 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms