Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sorbs3Q9R1Z8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sorbs3Q9R1Z8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms