Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc6Q9R1S7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abcc6Q9R1S7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abcc6Q9R1S7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abcc6Q9R1S7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abcc6Q9R1S7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abcc6Q9R1S7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abcc6Q9R1S7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abcc6Q9R1S7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abcc6Q9R1S7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abcc6Q9R1S7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abcc6Q9R1S7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abcc6Q9R1S7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abcc6Q9R1S7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abcc6Q9R1S7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abcc6Q9R1S7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Abcc6Q9R1S7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abcc6Q9R1S7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abcc6Q9R1S7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abcc6Q9R1S7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Abcc6Q9R1S7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms