Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psma1Q9R1P4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Psma1Q9R1P4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms