Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma4Q9R1P0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psma4Q9R1P0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psma4Q9R1P0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms