Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Slit2Q9R1B9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Slit2Q9R1B9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slit2Q9R1B9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slit2Q9R1B9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms