Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mpdu1Q9R0Q9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mpdu1Q9R0Q9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms