Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H0

Acox1, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acox1Q9R0H0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acox1Q9R0H0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acox1Q9R0H0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms