Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nek3Q9R0A5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nek3Q9R0A5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nek3Q9R0A5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms